Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RHOXF2Q9BQY4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms