Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNAQ96QF7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNAQ96QF7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNAQ96QF7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNAQ96QF7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNAQ96QF7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms