Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms