Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGF29Q96ES7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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