Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP13Q92995 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP13Q92995 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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