Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms