Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms