Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASSF3Q86WH2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms