Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PNMA8AQ86V59 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms