Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPER4Q7RTX7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms