Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OTOP1Q7RTM1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms