Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms