Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms