Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms