Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms