Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms