Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms