Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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