Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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