Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms