Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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GRIK5Q16478 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK5Q16478 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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