Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATP6AP1Q15904 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATP6AP1Q15904 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms