Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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NCOA1Q15788 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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NCOA1Q15788 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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