Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPRHQ149N8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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