Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNC3Q14003 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNC3Q14003 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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