Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTCH1Q13635 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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