Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRJQ12913 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PTPRJQ12913 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRJQ12913 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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