Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms