Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SREBF2Q12772 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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