Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms