Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLOD1Q02809 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms