Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OTUD4Q01804 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms