Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms