Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKL1Q00532 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms