Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms