Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM3AP98173 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms