Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms