Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA9P57773 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA9P57773 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA9P57773 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA9P57773 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA9P57773 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA9P57773 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms