Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BACE1P56817 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms