Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRT6CP48668 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms