Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PIK3CBP42338 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms