Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CTRLP40313 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CTRLP40313 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms