Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGAEP38570 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms