Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLD1P28340 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
POLD1P28340 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms