Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
APCP25054 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
APCP25054 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
APCP25054 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
APCP25054 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
APCP25054 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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