Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDSP20132 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SDSP20132 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SDSP20132 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SDSP20132 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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