Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB4P17483 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms