Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA4P13612 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms