Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCNAP12004 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCNAP12004 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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