Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TOP2AP11388 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms